Университет XXI века Биошок

В Университете ИТМО в середине мая прошла школа по системной биологии. За четыре дня участники семинаров смогли познакомиться с последними научными достижениями и пообщаться с ведущими специалистами.

Со стороны нашего вуза мероприятие организовали Федор Царев, Алексей Сергушичев и Павел Федотов вместе с представителями Института биоинформатики Николаем Вяххи и Анной Черныш. Они пригласили спикеров Максима Артемова и Александра Предеуса из Университета Вашингтона в Сент-Луисе и Никиту Артемова из Университета Гарварда.

Мероприятие было рассчитано на людей с глубокими знаниями в области биоинформатики. Целью школы было показать слушателям, как они могут применять свои навыки на практике, дать им почувствовать связь разрабатываемых ими методов с задачами в реальном мире. Попасть на семинары мог не каждый. Из внушительного числа заявок было отобрано лишь 25.

Основной темой занятий стали технологии секвенирования (метод получения глобальной информации о системе – прим. автора). За четыре дня слушателей познакомили с современными методами медицинской генетики, секвенированием РНК и анализом эпигеномных модификаций. Теоретические занятия пересекались с практическими секциями, где участники работали с конкретными данными.

Каждый день был посвящен отдельной теме. Например, 16 мая рассматривались вопросы медицинской и популяционной генетики. Спикер Никита Артемов рассказал об общих принципах анализа мутаций ДНК, отборе пациентов и контроле качества фокус-групп, доступе и работе с картами гаплотипов, анализе данных генотипирования и редких мутациях. В течение дня слушатели освоили программы, используемые в ведущих генетических лабораториях мира.

Максим Артемов, Университет Вашингтона в Сент-Луисе:

– Мероприятие такого рода мы организовывали впервые. Ребята из Университета ИТМО и Института биоинформатики проделали огромную работу. Дальше все зависит от отзывов. Нам интересно продолжить серию таких семинаров. И если слушателям все понравилось, мы с удовольствием повторим этот эксперимент.